ارزیابی ژن‌ها و مسیرهای مولکولی دخیل در ایجاد بیماری‌های قلبی عروقی در بیماران پره اکلامپسی با رویکرد سیستم بیولوژی

مقالات آماده انتشار

نوع مقاله : اصیل پژوهشی

نویسندگان

1 Tehran

2 １- آزمایشگاه ژنتیک و بالینی نورژن، مرکز تحقیقات مولکولی، اهواز، ایران.

3 موسسه عالی آموزش و پژوهش طب انتقال خون، تهران، ایران.

4 ３- واحد توسعه تحقیقات بالینی شهید اکبرآبادی (SHACRDU)، دانشکده پزشکی، دانشگاه علوم پزشکی ایران، تهران، ایران.

5 ４- گروه سلول‌های بنیادی و زیست‌شناسی تکوینی، مرکز تحقیقات علوم سلولی، پژوهشگاه رویان برای زیست‌شناسی و فناوری سلول‌های بنیادی،

10.22038/ijogi.2025.89527.6485

چکیده

مقدمه: فشار خون بالا در پره اکلامپسی یکی از مهمترین عوارض در این بیماران است که خطر ابتلا به بیماری قلبی عروقی را افزایش می‌دهد. با توجه به اینکه ژن ها نقش مهمی از طریق فرایند های بیولوژیکی در بروز فشار خون دارند استفاده از آنالیز بیوانفورماتیک که یک روش جدید و نوین می باشد می تواند در شناسایی ژن های اثر گذار موثر باشد.

روش کار: برای استخراج داده ها از پایگاه داده GEO استفاده گردید. دیتابیس های استخراج شده شامل GSE48424، GSE99007 و GSE91189 بودند. این داده ها در ارتباط با بیماران مبتلا به اشکال شدید و غیر شدید پره اکلامپسی بود. معیار انتخاب شده برای داده ها شامل |logFC| ببیشتر از یک و p<0.05 بود. در نهایت آنالیز داده ها با استفاده از ابزار GEO2R انجام گردید.

نتایج: پس از خوشه‌بندی ژن‌ها برای مجموعه داده‌ها، ۲۳۵ ژن با بیان بالا و ۵۴۶ ژن با بیان پایین در فرم غیر شدید و شدید پره اکلامپسی به دست آمد. نتایج نشان داد تغییر بیان ژن ها بین بیماران و افراد سالم عمدتا در فرایند های بیولوژیکی شامل التهاب، چسبندگی سلولی، و متابولیسم سلولی نقش داشتند. ژن هایی که اصلی ترین نقش و بیشترین ارتباط با سایر ژن ها را داشتند شامل HLTF، SUMO1، KDR، SNRPD3، DERL2، VCP، EIF4B، NOTCH، MEF2A و PTPRC بودند

نتیجه گیری: می توان گفت احتمالا شناسایی مسیر های بالا دست و پایین دست ژن ها می تواند در طراحی استراتژی های پیشگیری کننده و درمانی کمک کننده باشد که نیازمند مطالعات بیشتر است.

کلیدواژه‌ها

موضوعات

عنوان مقاله [English]

Evaluation of genes and molecular pathways involved in the development of cardiovascular diseases in preeclampsia patients using a systems biology approach

نویسندگان [English]

  • zahra Asadi Kalameh 1
  • Javad Mohammadi-Asl 2
  • mehran amrovani 3
  • shima ghezelbash 4
  • arsalan jalili 5
1 Tehran
2 1- Noorgene Genetic &amp; Clinical Laboratory, Molecular Research Center, Ahvaz, IRAN.
3 2- High Institute for Education and Research in Transfusion Medicine, Tehran, Iran.
4 3- Shahid AkbarAbadi Clinical Research Development unit (SHACRDU), School of Medicine, Iran University of Medical Sciences, Tehran, Iran.
5 4- Department of Stem Cells and Developmental Biology, Cell Science Research Center, Royan Institute for Stem Cell Biology and Technology, ACER, Tehran, Iran.
چکیده [English]

Background: High blood pressure in preeclampsia is one of the most important complications in these patients, which increases the risk of cardiovascular disease. Given that genes play an important role in the occurrence of blood pressure through biological processes, the use of bioinformatics analysis, which is a new and innovative method, can be effective in identifying influential genes.

Method: The GEO database was used to extract data. The extracted databases included GSE48424, GSE99007, and GSE91189. These data were related to patients with severe and non-severe forms of preeclampsia. The criteria selected for the data included |logFC| greater than one and p<0.05. Finally, data analysis was performed using the GEO2R tool.

Result: After clustering genes for the dataset, 235 highly expressed genes and 546 low expressed genes were obtained in non-severe and severe forms of preeclampsia. The results showed that the changes in gene expression between patients and healthy individuals were mainly involved in biological processes including inflammation, cell adhesion, and cell metabolism. The genes that had the most important roles and the most correlations with other genes were HLTF, SUMO1, KDR, SNRPD3, DERL2, VCP, EIF4B, NOTCH1, SOCS3, CBL, ICAM-1, ITGB2, STRN, MEF2A, and PTPRC. Also, the most important microRNAs were miR-3135-3P, miR-5085, and miR-6-5085.

Conclusion: It can be said that identifying the upstream and downstream pathways of genes can probably help in designing preventive and therapeutic strategies, which requires further studies.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Preeclampsia
  • Hypertension
  • Cardiovascular Disease
  • System Biology
مجله زنان، مامایی و نازایی ایران

مقالات آماده انتشار، پذیرفته شده
انتشار آنلاین از تاریخ 12 آبان 1404

فایل ها

هم رسانی

ارجاع به این مقاله

آمار